ИФХЭ РАН

База данных собрана из открытых источников, таких как USPTO (United States Patent and Trademark Office), WIPO (World Intellectual Prperty Organization), ФИПС (Федеральный институт промышленной собственности), PMC (PubMed Central), Crossref, Springer, Elsevier, Wiley, American Physical Society, American Chemical Society, SAGE Publication, Public Library of Science, De Gruyter, IEEE, Cambridge University Press, Oxford University Press, Royal Society of Chemistry и других.

Возможности платформы обеспечивают анализ свойств соединений, прогнозирование реакций, спектральных данных, автоматическое распознавание молекулярных структур из PDF-документов, а также данных представленных в формате SMILES, InChI, InChI key. Доступна работа с датасетами молекул и химических реакций: создание, хранение и анализ собственных наборов данных.

Платформа позволяет производить поиск по структурам, поиск по подобию и по реакциям, а также поддерживает ссылки на внешние источники данных.

Функционал платформы даёт доступ к следующим модулям:

• Модуль «Молекулярный редактор» – предназначен для прогнозирования свойств соединений, которых нет в базе данных Синтелли.
• Модуль «Датасеты» – позволяет создавать, загружать, редактировать и проводить анализ личных, корпоративных (датасеты компании) и тематических датасетов.
• Модуль «SynMap» – визуализация анализа химического пространства (2D/3D), основанная на предобученной нейросетевой модели, позволяющая получить быстрое и наглядное представление об основных группах химических соединений, которые есть в датасете.
• Модуль «Прогнозирование реакций» – предназначен для планирования синтеза соединений и предсказания путей химических превращений.
• Модуль «Спектры» – содержит три модуля для прогнозирования различных типов спектральных данных, каждый из которых даёт информацию о структуре и свойствах анализируемых молекул: ядерный магнитный резонанс (ЯМР), масс-спектрометрия (QToF MS/MS) и инфракрасная спектроскопия.
• Модуль «Стоимость синтеза» – позволяет прогнозировать стоимость синтетических соединений, учитывающий множество факторов, включая масштаб производства и сложность синтеза.
• Модуль «PDF2SMILES» – инструмент оптического распознавания молекулярных структур и структур Маркуша из PDF-документов и экспорта структур из документов в отдельный датасет для дальнейшего анализа.
• Модуль «SMILES2IUPAC» – автоматизированный инструмент конвертации химических структур из формата SMILES в систематическое наименование по номенклатуре IUPAC.
• Модуль «Статистика» – в разделе представлена информация о точности и надежности моделей, используемых в системе по двум типам метрик: RMSE (Root Mean Square Error) для измерения среднеквадратичной ошибки предсказаний и ROC AUC (Receiver Operating Characteristic Area Under) для измерения качества бинарной классификации.

Порядок предоставления доступа к платформе Синтелли:

Тестовый доступ к ресурсу предоставляется по индивидуальным логинам и паролям пользователей, самостоятельно зарегистрировавшихся на платформе, используя адреса корпоративной почты ИФХЭ РАН (домены @phyche.ac.ru, @elchem.ac.ru, @ipc.rssi.ru) и компьютеры институтской сети.

Полезные материалы:

• Функциональные характеристики компонентов программного обеспечения
• Руководство пользователя
• Видео-инструкции по работе с модулями платформы
• Записи вебинаров, проведенные компанией «Синтелли»

Источники: ООО «Синтелли», РЦНИ